202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2250 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  97.52 
 
 		 242 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  79.75 
 
 		 241 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  38.72 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  31.36 
 
 		 235 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  33.75 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  33.61 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  31.98 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  31.98 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  31.58 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 		 278 aa  99  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  32.33 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  30.8 
 
 		 259 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  31.76 
 
 		 261 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 294 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  28.78 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 311 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 294 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  29.54 
 
 		 294 aa  85.9  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  28.78 
 
 		 294 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4939  alpha/beta hydrolase fold protein  32.01 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00537636  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  29.72 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  27.73 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  29.44 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  31.21 
 
 		 336 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  29.44 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  30.94 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  30.94 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  30.94 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  30.94 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  30.94 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  30.94 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  28.57 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3411  putative esterase  32.65 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  30.36 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2009  hydrolase, alpha/beta fold family protein  30.12 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000348301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  28.57 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  32.08 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  28.14 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  27.71 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  27.73 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  30.05 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  35.48 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  26.92 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  34.03 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  31.38 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  31.38 
 
 		 276 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  31.38 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2687  putative esterase  30.51 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0278  putative esterase  26.69 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  27.39 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  28.09 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  29.05 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  26.61 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  27.94 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  30.21 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  26.29 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3359  hydrolase, alpha/beta fold family protein  30.34 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4030  hypothetical protein  29.74 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0222  putative esterase  26.77 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.838594  normal  0.101854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  28.75 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  28.25 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  27.05 
 
 		 260 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  26.58 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02942  conserved hypothetical protein  27.94 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38390  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.49 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  32.49 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  29.11 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  25 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3013  hypothetical protein  33.61 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3059  hypothetical protein  33.61 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  27.48 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7175  hypothetical protein  28.15 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  28.28 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3363  hypothetical protein  32.26 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286725  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3028  hypothetical protein  32.79 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.310748  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  28.99 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  25.73 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  28.4 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  33.91 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3533  putative esterase  25.71 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.433428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  27.64 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  28.63 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  27.71 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2999  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.049692 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  28.99 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35630  hypothetical protein  29.41 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7232  hypothetical protein  32.52 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0340  putative esterase  28.22 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  30.38 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3566  hypothetical protein  29.84 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370934  normal  0.0727224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1696  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  30.04 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>