159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4620 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  467  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  34.16 
 
 
238 aa  101  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  33.76 
 
 
268 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  33.62 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  29.31 
 
 
259 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  30.34 
 
 
252 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  29.65 
 
 
265 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  31.78 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  32.2 
 
 
244 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  30.36 
 
 
263 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  32.63 
 
 
261 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  30.36 
 
 
263 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  30.77 
 
 
257 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  32.03 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  30.36 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  30.36 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  29.46 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  29.36 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  29.41 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  29.31 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  30.71 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  26.67 
 
 
235 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  29.46 
 
 
260 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  28.57 
 
 
242 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  31.33 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  27.73 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  32.02 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  28.21 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  30.73 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  31.65 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  29.17 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10320  conserved hypothetical protein  27.35 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  29.64 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  30.6 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  28.69 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  30.96 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  26.97 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  27.54 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2009  hydrolase, alpha/beta fold family protein  28.91 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000348301  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  27.73 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  29.15 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  28.27 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  29.46 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4669  hypothetical protein  28.57 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0416711  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  28.06 
 
 
261 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2730  hypothetical protein  32.22 
 
 
249 aa  72  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.260447  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  28.57 
 
 
332 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  29.17 
 
 
278 aa  72  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  28.88 
 
 
257 aa  71.6  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  29.67 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  26.55 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  30.17 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  30.17 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  27.82 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  30.86 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  27.39 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  27.35 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  28.02 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  32.91 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  24.02 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  30.53 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  29.05 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  29.61 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4902  hypothetical protein  29.17 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  28.51 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  31.95 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  27.06 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0370  hypothetical protein  29.24 
 
 
260 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  31.22 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  26.07 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  28.57 
 
 
256 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  25.21 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02942  conserved hypothetical protein  26.02 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  29.44 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  32.63 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2999  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.049692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  27.82 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  27.82 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  27.92 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  27.47 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  29.18 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  27.42 
 
 
256 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3441  secreted protein  32.29 
 
 
200 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190363  normal  0.109343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  24.89 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  27.62 
 
 
231 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 
278 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  30.27 
 
 
282 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
242 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  24.35 
 
 
257 aa  62.8  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2687  putative esterase  29.18 
 
 
244 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  30.11 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>