178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2994 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  100 
 
 		 257 aa  520  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  73.93 
 
 		 289 aa  397  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  76.26 
 
 		 257 aa  378  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  64.52 
 
 		 257 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  66.52 
 
 		 276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  60 
 
 		 276 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  59.29 
 
 		 276 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  59.29 
 
 		 276 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  52 
 
 		 332 aa  231  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  51.33 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  51.1 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  46.52 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  45.58 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  48.65 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  46.26 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  42.61 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  47 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  40.96 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  45.69 
 
 		 256 aa  194  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  42.17 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  42.79 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  42.36 
 
 		 256 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  42.5 
 
 		 262 aa  191  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  40.54 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  44.44 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  41.41 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  44.64 
 
 		 238 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  41.91 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  41.41 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0370  hypothetical protein  43.61 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  42.67 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  42.99 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  42.4 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  42.4 
 
 		 263 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  43.62 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  44.64 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  46.45 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  42.86 
 
 		 265 aa  181  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4871  hypothetical protein  58.74 
 
 		 147 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3294  hypothetical protein  58.74 
 
 		 147 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  40.89 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  42.34 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  42.34 
 
 		 252 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  40.09 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  38.76 
 
 		 282 aa  176  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  41.94 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  39.65 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  41.47 
 
 		 263 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  41.15 
 
 		 250 aa  171  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4902  hypothetical protein  40.43 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  41.41 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  42.55 
 
 		 264 aa  168  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  39.11 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  40.35 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  41.18 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  39.82 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  40.54 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  39.82 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  40.62 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  39.56 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  40.64 
 
 		 236 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4030  hypothetical protein  41.15 
 
 		 231 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  39.64 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7175  hypothetical protein  38.74 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  36.64 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  40.69 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  39.11 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  41 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  37.33 
 
 		 234 aa  149  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  39.34 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  37.55 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  38.7 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  37.92 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  37.17 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  34.21 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  36.71 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  35.06 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  38.57 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  34.63 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  33.86 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2730  hypothetical protein  34.98 
 
 		 249 aa  115  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.260447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  34.4 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3176  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0134002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3441  secreted protein  33.68 
 
 		 200 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190363  normal  0.109343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 		 278 aa  85.1  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  26.72 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  29.91 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  28.75 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3798  putative alpha/beta hydrolase family protein  24.9 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1696  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10320  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  33.04 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  28.33 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>