31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4997 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4997  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1962  esterase EstC  48.91 
 
 		 308 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4641  alpha/beta hydrolase fold protein  50.19 
 
 		 277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5732  esterase  46.27 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.668401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  41.28 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.263244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2474  esterase  63.64 
 
 		 100 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4939  alpha/beta hydrolase fold protein  37.64 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00537636  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  32.44 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  33.33 
 
 		 301 aa  99.4  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  32.06 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  33.58 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  33.58 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  33.58 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  33.58 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  33.58 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 294 aa  95.9  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  33.21 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  33.21 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  30.31 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  25.74 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  22.76 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  28.11 
 
 		 238 aa  52.4  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  26.89 
 
 		 245 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  30 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  27.8 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0060  putative esterase/lipase  37.38 
 
 		 235 aa  42.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>