86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4641 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4641  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
277 aa  558  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1962  esterase EstC  51.36 
 
 
308 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5732  esterase  49.81 
 
 
320 aa  245  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.668401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4997  hypothetical protein  50.19 
 
 
310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  43.68 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.263244 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  35.13 
 
 
294 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  36.2 
 
 
301 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  36.2 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  36.2 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  36.2 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  36.2 
 
 
336 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  36.2 
 
 
301 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  36.2 
 
 
309 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  36.2 
 
 
336 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  34.05 
 
 
294 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4939  alpha/beta hydrolase fold protein  38.49 
 
 
292 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00537636  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  34.77 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 
294 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  33.69 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  33.69 
 
 
311 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2474  esterase  50 
 
 
100 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534275  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  28.31 
 
 
238 aa  79  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  23.84 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  24.48 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  26.71 
 
 
245 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
237 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  27.65 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  26.88 
 
 
261 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  27.31 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
240 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  28.03 
 
 
241 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0641  hypothetical protein  25.26 
 
 
261 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0033841  normal  0.0977111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6811  salicylate esterase  32.2 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545917  hitchhiker  0.00506969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  24.5 
 
 
208 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  26.16 
 
 
261 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  31.9 
 
 
462 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  25.99 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  25.63 
 
 
256 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0763  alpha/beta fold family hydrolase  29.46 
 
 
323 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  25.63 
 
 
256 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0672  alpha/beta hydrolase superfamily protein  33.63 
 
 
344 aa  48.9  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0529058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  29.33 
 
 
453 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 
284 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  26.74 
 
 
231 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  27.22 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  27.35 
 
 
229 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  25.99 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  25.86 
 
 
230 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  28.45 
 
 
462 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16031  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  29.2 
 
 
323 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2556  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
291 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0060  putative esterase/lipase  31.62 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2999  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.049692 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  26.03 
 
 
230 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
364 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7232  hypothetical protein  28.5 
 
 
224 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
310 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4149  hypothetical protein  25.64 
 
 
231 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.634975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4539  hypothetical protein  25.64 
 
 
231 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.390237  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  32.17 
 
 
298 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 
461 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
364 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  32.77 
 
 
241 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 
294 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 
298 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
272 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
277 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  22.58 
 
 
241 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1737  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 
373 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
297 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  28.81 
 
 
456 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  23.83 
 
 
259 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2343  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 
279 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302019  decreased coverage  0.000831021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4079  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
246 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.313726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  34.48 
 
 
275 aa  42.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
288 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2020  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 
216 aa  42  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0391811  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>