15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2474 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2474  esterase  100 
 
 
100 aa  207  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534275  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4997  hypothetical protein  63.64 
 
 
310 aa  125  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1962  esterase EstC  48.45 
 
 
308 aa  100  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4641  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
277 aa  100  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5732  esterase  52.13 
 
 
320 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.668401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  51.04 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.263244 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  42.19 
 
 
294 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4939  alpha/beta hydrolase fold protein  40.79 
 
 
292 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00537636  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  42.19 
 
 
294 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  35.05 
 
 
294 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 
311 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 
294 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 
294 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  34.02 
 
 
294 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  39.06 
 
 
301 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>