More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2556 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2556  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
291 aa  590  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  27.2 
 
 
456 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 
258 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  24.01 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  26.27 
 
 
260 aa  62.4  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 
309 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  25.45 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
329 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.08 
 
 
374 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  24.5 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.53 
 
 
368 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.18 
 
 
368 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 
297 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  25.94 
 
 
256 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  25.94 
 
 
256 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 
301 aa  58.9  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  26.78 
 
 
462 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  24 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  24.89 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  24.1 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  26.56 
 
 
256 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25.37 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  25.52 
 
 
293 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.35 
 
 
273 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  24.88 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  21.89 
 
 
291 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30 
 
 
372 aa  56.6  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 
281 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 
315 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.88 
 
 
368 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2433  hypothetical protein  23.43 
 
 
306 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  20.33 
 
 
279 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  28.19 
 
 
263 aa  55.8  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
272 aa  55.8  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  25.1 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  25.1 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  24.31 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  25.54 
 
 
404 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  25.1 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  24.59 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  20.62 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  28.83 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  25.64 
 
 
462 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  22.79 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  24.36 
 
 
363 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
320 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  22.51 
 
 
272 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  25 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  22.09 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
345 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 
390 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  27 
 
 
269 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  28.06 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  25.32 
 
 
373 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0445  triacylglycerol lipase  24.25 
 
 
265 aa  53.1  0.000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.193973  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  24.14 
 
 
396 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  23.63 
 
 
453 aa  53.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 
305 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  24.26 
 
 
233 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
276 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  26.43 
 
 
350 aa  52.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
302 aa  52.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  25.75 
 
 
311 aa  52.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  22.95 
 
 
292 aa  52.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  24.15 
 
 
323 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  23.76 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  27.49 
 
 
263 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  23.63 
 
 
282 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3789  alpha/beta hydrolase fold  39.19 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  23.18 
 
 
362 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  23.23 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 
312 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 
364 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.24 
 
 
370 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  23.56 
 
 
304 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  22.87 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  23.39 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  24.05 
 
 
256 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  22.18 
 
 
311 aa  51.2  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  23.39 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 
321 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.53 
 
 
370 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 
321 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 
321 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  19.5 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>