97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3441 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3441  secreted protein  100 
 
 		 200 aa  388  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190363  normal  0.109343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  58.42 
 
 		 232 aa  211  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  43.43 
 
 		 286 aa  138  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  43.15 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  40.82 
 
 		 260 aa  131  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  41.33 
 
 		 249 aa  131  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  41.33 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  41.92 
 
 		 261 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  45.36 
 
 		 283 aa  124  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  41.03 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  40.41 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  39.15 
 
 		 260 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  41.54 
 
 		 255 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  41.03 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  41.97 
 
 		 259 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  38.74 
 
 		 274 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  39.29 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  37.89 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  37.56 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  38.58 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  39.5 
 
 		 252 aa  111  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  35.2 
 
 		 262 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  37.11 
 
 		 229 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  38.69 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  37.82 
 
 		 256 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  36.68 
 
 		 231 aa  108  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  40.33 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2730  hypothetical protein  43.37 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.260447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  38.14 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  36.92 
 
 		 232 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  36.02 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  37.44 
 
 		 258 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  37.95 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  37.38 
 
 		 332 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4902  hypothetical protein  39.18 
 
 		 268 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  37.63 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  40.5 
 
 		 234 aa  104  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  40.5 
 
 		 252 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  37.44 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  36.46 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  42.64 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  34.87 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  36.41 
 
 		 278 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  36.65 
 
 		 259 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  34 
 
 		 257 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  36.56 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  39.5 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  37.93 
 
 		 309 aa  101  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  34.57 
 
 		 259 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  36.7 
 
 		 259 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  37.11 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  33.51 
 
 		 263 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  36.56 
 
 		 259 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  36.6 
 
 		 250 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  32.47 
 
 		 259 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  36.17 
 
 		 255 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  34.02 
 
 		 255 aa  95.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  31 
 
 		 289 aa  94.7  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  37.17 
 
 		 267 aa  94.7  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  32.49 
 
 		 256 aa  92.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  36.27 
 
 		 282 aa  92.8  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  40.32 
 
 		 257 aa  91.7  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4030  hypothetical protein  36.22 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  34.67 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 		 258 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3176  alpha/beta hydrolase fold  38.97 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0134002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0370  hypothetical protein  32.82 
 
 		 260 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  30.05 
 
 		 226 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  30.46 
 
 		 234 aa  88.6  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  29.85 
 
 		 259 aa  87.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  31.32 
 
 		 263 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  35.33 
 
 		 256 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  30.77 
 
 		 263 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  35.38 
 
 		 257 aa  85.1  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  33.96 
 
 		 257 aa  85.1  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  33.33 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  33.33 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  33.33 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  30.22 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  31.61 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7175  hypothetical protein  33.67 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  29.67 
 
 		 263 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  29.12 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  33.14 
 
 		 256 aa  78.2  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  33.7 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  30.93 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  30.57 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  32.45 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3294  hypothetical protein  29.03 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4871  hypothetical protein  29.03 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 		 278 aa  52  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  29.5 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  22.61 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  27.98 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6798  hypothetical protein  60.61 
 
 		 381 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  24.86 
 
 		 235 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  24.74 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>