154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5324 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  77.29 
 
 		 252 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  76.89 
 
 		 252 aa  343  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  59.91 
 
 		 256 aa  275  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  57.76 
 
 		 256 aa  261  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  52.17 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  49.62 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  53.74 
 
 		 282 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  51.3 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  49.35 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  47.95 
 
 		 256 aa  222  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  52.63 
 
 		 264 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  44.13 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  49.58 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  49.33 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  47.15 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  48.03 
 
 		 266 aa  204  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0370  hypothetical protein  47.96 
 
 		 260 aa  202  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  48.84 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  43.7 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  47.97 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  48.03 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  42.25 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  45.1 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  47.93 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  45.61 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  43.8 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  43.8 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  41.91 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  42.98 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  42.69 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  40.98 
 
 		 289 aa  184  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  45.3 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  42.98 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  42.98 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  43.29 
 
 		 309 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  43.81 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  43.95 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  40.16 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  42.11 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  43.36 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  43.75 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  42.86 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  42.74 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  40.99 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  43.17 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  41.91 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  41.91 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  45.02 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4902  hypothetical protein  41.96 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  42.08 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  42.45 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  40.27 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  43.64 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  42.48 
 
 		 230 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  41.07 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  45.07 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  42.54 
 
 		 232 aa  161  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  43.5 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  40.95 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  41.89 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  41.59 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  40.71 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  41.81 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  42.79 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  43.23 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  39.73 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  41.05 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  36.82 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  39.13 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  39.15 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  38.53 
 
 		 249 aa  135  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  40 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  36.49 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  34.78 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  38.1 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  35.83 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  36.99 
 
 		 232 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4030  hypothetical protein  34.7 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  37.2 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2730  hypothetical protein  37.83 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.260447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  34.14 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  36.94 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7175  hypothetical protein  32.88 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3441  secreted protein  39.5 
 
 		 200 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190363  normal  0.109343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3176  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0134002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4871  hypothetical protein  35.86 
 
 		 147 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3294  hypothetical protein  35.86 
 
 		 147 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  29.36 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  28.51 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02942  conserved hypothetical protein  25.73 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 311 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  27.16 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>