129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1076 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  100 
 
 
211 aa  408  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  49.29 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  46.92 
 
 
221 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  44.55 
 
 
255 aa  179  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  48.83 
 
 
245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  44.19 
 
 
216 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  44.71 
 
 
268 aa  171  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  42.79 
 
 
216 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  49.06 
 
 
222 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  46.41 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  41.98 
 
 
229 aa  160  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  45.24 
 
 
241 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  41.43 
 
 
309 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  35.24 
 
 
393 aa  119  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  36.07 
 
 
254 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  29.3 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  36.32 
 
 
220 aa  106  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  35.21 
 
 
216 aa  94.7  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  26.55 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  28.24 
 
 
254 aa  91.7  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  28.24 
 
 
254 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  38.65 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  23.67 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  32.23 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  29.87 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  30.41 
 
 
249 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  26.91 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  30.05 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  27.01 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  28.5 
 
 
393 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  29.7 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  25.47 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  36.3 
 
 
225 aa  59.3  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  29.58 
 
 
284 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  33.01 
 
 
324 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  37.14 
 
 
334 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  29.65 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  31.6 
 
 
210 aa  52  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  27.27 
 
 
382 aa  51.6  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  40 
 
 
294 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  32.41 
 
 
285 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  34.48 
 
 
263 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  35.4 
 
 
282 aa  49.3  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  32.11 
 
 
276 aa  48.9  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
298 aa  48.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  35.05 
 
 
281 aa  48.5  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  30.93 
 
 
253 aa  48.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  30.19 
 
 
294 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 
289 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  33.33 
 
 
281 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  31.86 
 
 
281 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  30.39 
 
 
338 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
289 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  44.26 
 
 
364 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  32.52 
 
 
286 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  30.39 
 
 
338 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  39.36 
 
 
261 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  37.14 
 
 
298 aa  45.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  28.57 
 
 
235 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  31.73 
 
 
249 aa  45.1  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  27.05 
 
 
222 aa  45.1  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  31.86 
 
 
276 aa  45.1  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.45 
 
 
370 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  34.29 
 
 
289 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  29.73 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
306 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
306 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  32.06 
 
 
303 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  30.08 
 
 
341 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  30.08 
 
 
360 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  30.08 
 
 
360 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  41.94 
 
 
364 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  44.26 
 
 
364 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
299 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  32.06 
 
 
303 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 
276 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  35.45 
 
 
339 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  30.08 
 
 
364 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 
289 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  28.46 
 
 
364 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  44.26 
 
 
364 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  31.71 
 
 
364 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0060  putative esterase/lipase  32.76 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  44.26 
 
 
364 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 
302 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  36.19 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0870  alpha/beta hydrolase fold protein  21.21 
 
 
248 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.38 
 
 
288 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0947  hypothetical protein  28.71 
 
 
683 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119116  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  44.26 
 
 
364 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  30.09 
 
 
332 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  34.41 
 
 
367 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  38.61 
 
 
246 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  32.71 
 
 
344 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
275 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 
279 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  37.93 
 
 
302 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
235 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
301 aa  43.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>