More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0870 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0870  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
248 aa  501  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  23.48 
 
 
265 aa  79  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  24.06 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  22.05 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.95 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  22.35 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  21.94 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  22.53 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  23.04 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  22.92 
 
 
267 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  22.8 
 
 
425 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  21.43 
 
 
287 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  22.83 
 
 
367 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  21.76 
 
 
288 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  23.92 
 
 
262 aa  62.8  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  20.99 
 
 
293 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  20.99 
 
 
288 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  19.84 
 
 
271 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  20.99 
 
 
293 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  20.99 
 
 
293 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  21.76 
 
 
288 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  20.43 
 
 
279 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  20.99 
 
 
288 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  18.93 
 
 
260 aa  62.4  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  18.93 
 
 
260 aa  62.4  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  20.99 
 
 
293 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  21.97 
 
 
289 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  22.9 
 
 
281 aa  62  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 
265 aa  62  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  22.62 
 
 
275 aa  62  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  23.79 
 
 
263 aa  62  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  24.06 
 
 
296 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.15 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  19.38 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  22.1 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.46 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  20.88 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.19 
 
 
370 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  21.84 
 
 
345 aa  62  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  30 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  22.96 
 
 
370 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  19.38 
 
 
298 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  23.05 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  20.68 
 
 
263 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  23.05 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  20.43 
 
 
279 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
280 aa  59.7  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.54 
 
 
264 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  21.27 
 
 
397 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  23.38 
 
 
286 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  26.09 
 
 
270 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  20.38 
 
 
299 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.89 
 
 
371 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.89 
 
 
371 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  21.14 
 
 
276 aa  58.9  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  24.86 
 
 
280 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  22.88 
 
 
277 aa  58.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 
272 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  21.63 
 
 
266 aa  58.9  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  21.4 
 
 
286 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
258 aa  58.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  26.09 
 
 
270 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  22.75 
 
 
368 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  21.88 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2285  putative hydrolase  22.67 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.45293  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  22.78 
 
 
290 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  21.57 
 
 
312 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  19.03 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  20.25 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  21.81 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.89 
 
 
371 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  20.66 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  19.62 
 
 
288 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
291 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  22.04 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  26.34 
 
 
227 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  21.34 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 
504 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  25.23 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0442  alpha/beta hydrolase fold  23.14 
 
 
589 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.895468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  20.56 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2841  putative hydrolase  22.22 
 
 
300 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 
297 aa  57  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  21.88 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  21.56 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.89 
 
 
371 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  21.56 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  23.21 
 
 
324 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  21.69 
 
 
277 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  20.63 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  21.56 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>