More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0442 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0442  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
589 aa  1144    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.895468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3239  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
303 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.429709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  27.6 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0399  hypothetical protein  27.27 
 
 
283 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
290 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 
273 aa  73.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
283 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 
291 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
314 aa  69.7  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  22.78 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.18 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
304 aa  67  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
291 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
291 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
291 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 
289 aa  66.6  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
274 aa  66.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 
289 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
320 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 
284 aa  66.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  28.01 
 
 
298 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
288 aa  65.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  25.41 
 
 
286 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  40.17 
 
 
316 aa  65.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  28.89 
 
 
285 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 
302 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  27.34 
 
 
318 aa  64.7  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
307 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 
271 aa  64.7  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
299 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
283 aa  64.7  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
316 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
263 aa  64.7  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
287 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
302 aa  64.3  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  21.88 
 
 
253 aa  64.3  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
302 aa  63.9  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
302 aa  63.9  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
339 aa  63.9  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
339 aa  63.9  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.67 
 
 
288 aa  64.3  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
292 aa  63.9  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 
333 aa  63.5  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 
300 aa  63.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
288 aa  63.9  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
294 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  23.64 
 
 
258 aa  63.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
299 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
299 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
299 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
299 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
299 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
299 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 
252 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  33.17 
 
 
289 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
285 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
285 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
293 aa  62.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
299 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
290 aa  62.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
309 aa  62  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 
316 aa  62  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 
302 aa  62  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
226 aa  62  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 
277 aa  61.6  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
285 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  31.22 
 
 
287 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 
298 aa  61.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 
264 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  26.74 
 
 
286 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.57 
 
 
294 aa  61.2  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 
301 aa  60.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  28.11 
 
 
291 aa  60.8  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 
260 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
278 aa  60.8  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
288 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
264 aa  60.8  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 
340 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
297 aa  60.5  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
322 aa  60.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
276 aa  60.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  20.94 
 
 
300 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
301 aa  60.5  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  36.44 
 
 
325 aa  59.7  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  20.94 
 
 
300 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  20.94 
 
 
300 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
289 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  20.94 
 
 
300 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  26.33 
 
 
275 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  20.94 
 
 
300 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 
293 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
302 aa  60.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 
296 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
312 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
278 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
295 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>