40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1762 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  36.95 
 
 
209 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  35.15 
 
 
220 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  39.32 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  37.31 
 
 
216 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  34.16 
 
 
393 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  31.73 
 
 
249 aa  88.2  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  35.03 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  31.86 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  29.47 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  27.4 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  31.82 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  26.32 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  29.9 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  29.25 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  26.34 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  27.13 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  29.41 
 
 
241 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  23.81 
 
 
325 aa  59.3  0.00000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  28.26 
 
 
216 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  29.65 
 
 
221 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  28.36 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  26.11 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  27.57 
 
 
216 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  29.52 
 
 
254 aa  51.6  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1275  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  29.25 
 
 
448 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.676872  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  29.52 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  25.79 
 
 
229 aa  48.5  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  34.19 
 
 
285 aa  48.5  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  25.49 
 
 
268 aa  48.1  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  32.08 
 
 
222 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  27.91 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  25.94 
 
 
254 aa  47.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  28.79 
 
 
309 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  20.1 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  26.6 
 
 
393 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  26.83 
 
 
281 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  28.3 
 
 
257 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  20.35 
 
 
236 aa  42.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  21.54 
 
 
247 aa  42.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>