46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2914 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  57.53 
 
 		 268 aa  259  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  55.79 
 
 		 241 aa  254  9e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  56.1 
 
 		 221 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  53.85 
 
 		 309 aa  218  8.999999999999998e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  48.57 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  46.15 
 
 		 221 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  45.45 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  44.02 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  37.26 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  38.5 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  38.21 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  37.02 
 
 		 207 aa  135  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  40.65 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  39.62 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  35.32 
 
 		 393 aa  122  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  30.05 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  29.58 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  29.58 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  37.91 
 
 		 209 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  33.77 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  25.97 
 
 		 236 aa  85.5  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  30.67 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  29.39 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  27.52 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  29.05 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  28.17 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  29.77 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  28.05 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  29.25 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  27.62 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  30.28 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  30.14 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  28.3 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 364 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  26.51 
 
 		 204 aa  49.3  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  29.46 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 		 324 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  25.6 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  25.78 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  25.6 
 
 		 303 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  31.78 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  34.51 
 
 		 430 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 351 aa  43.5  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  28.15 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  32.74 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>