66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3773 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  100 
 
 		 393 aa  812    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  38.32 
 
 		 216 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  36.06 
 
 		 309 aa  129  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  37.38 
 
 		 216 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  36.71 
 
 		 221 aa  126  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  35.32 
 
 		 255 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  33.62 
 
 		 255 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  35.92 
 
 		 241 aa  119  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  34.74 
 
 		 229 aa  119  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  35.22 
 
 		 245 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  32.72 
 
 		 221 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  34.88 
 
 		 211 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  33.49 
 
 		 254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  33.49 
 
 		 222 aa  111  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  30.69 
 
 		 268 aa  106  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  31.13 
 
 		 209 aa  89.7  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  28.04 
 
 		 254 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  28.04 
 
 		 254 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  24.31 
 
 		 247 aa  87.4  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  32.04 
 
 		 216 aa  86.7  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  27.4 
 
 		 207 aa  86.7  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  30.09 
 
 		 240 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  24.03 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  29.55 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  27.03 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  29.03 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  33.51 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  25.23 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  29.38 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  27.8 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  31.82 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  35.48 
 
 		 2169 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  32.74 
 
 		 313 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  29.46 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3209  helix-turn-helix domain protein  30.95 
 
 		 153 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0947  hypothetical protein  46.15 
 
 		 683 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  27.14 
 
 		 342 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  31.43 
 
 		 285 aa  49.7  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 275 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0281  hypothetical protein  35.71 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  24.88 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  25.6 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0751  hypothetical protein  31.67 
 
 		 492 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.870291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  25.96 
 
 		 222 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  23.64 
 
 		 284 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  28.97 
 
 		 203 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  26.6 
 
 		 210 aa  46.6  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  28.37 
 
 		 334 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  23.53 
 
 		 204 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0873  PGAP1 family protein  33.33 
 
 		 1257 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.730318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  26.71 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 279 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3124  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 		 247 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0321729  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3056  PGAP1 family protein  25.78 
 
 		 487 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  28.7 
 
 		 217 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5634  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 152 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  35 
 
 		 281 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  29.17 
 
 		 286 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0242  transcriptional regulator, XRE family  43.9 
 
 		 150 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3549e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3739  PGAP1 family protein  32.5 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  35.37 
 
 		 276 aa  43.5  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  33.71 
 
 		 2159 aa  43.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1557  hypothetical protein  36.92 
 
 		 343 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 310 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2031  PGAP1 family protein  29.13 
 
 		 442 aa  43.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  35.71 
 
 		 275 aa  42.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>