74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0968 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
364 aa  749    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  54.49 
 
 
351 aa  377  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  46.18 
 
 
317 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  46.84 
 
 
311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  46.51 
 
 
311 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  43.52 
 
 
339 aa  239  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  40.34 
 
 
323 aa  235  9e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  46.71 
 
 
305 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  43.96 
 
 
305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  43.61 
 
 
305 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  42.52 
 
 
309 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  42.12 
 
 
309 aa  229  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  43.19 
 
 
353 aa  227  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  43.67 
 
 
318 aa  212  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  40.13 
 
 
324 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  40.98 
 
 
332 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  41.91 
 
 
309 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  40.33 
 
 
332 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  37.46 
 
 
308 aa  189  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  35.96 
 
 
364 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  37.31 
 
 
364 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  37.17 
 
 
294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  36.9 
 
 
367 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  37.01 
 
 
364 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  36.61 
 
 
367 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  36.61 
 
 
367 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  36.61 
 
 
367 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  36.61 
 
 
367 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  37.01 
 
 
360 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  37.01 
 
 
360 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  36.61 
 
 
367 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 
365 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  36.61 
 
 
367 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 
377 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  36.2 
 
 
364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  36.42 
 
 
364 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 
289 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  36.42 
 
 
364 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  35.91 
 
 
367 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  36.2 
 
 
364 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  36.42 
 
 
364 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
296 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  33.95 
 
 
377 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  37.34 
 
 
296 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 
315 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 
296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
296 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  33.92 
 
 
364 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  36.24 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  45.54 
 
 
359 aa  97.8  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  29.58 
 
 
299 aa  90.1  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.39 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  27.08 
 
 
561 aa  68.9  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  26.16 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  30.88 
 
 
367 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  29.1 
 
 
357 aa  62.8  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  29.2 
 
 
414 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  30.33 
 
 
294 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.37 
 
 
273 aa  53.9  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  31.25 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02710  lipase 2, putative  30.72 
 
 
587 aa  49.7  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  30.27 
 
 
268 aa  46.6  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78871  predicted protein  36.51 
 
 
114 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  31.09 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  25.53 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  31.45 
 
 
361 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  27.81 
 
 
324 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5780  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 
369 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.390306  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3068  hypothetical protein  26.01 
 
 
380 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3176  hypothetical protein  26.01 
 
 
380 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.649914  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5996  hypothetical protein  29.55 
 
 
374 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2978  hypothetical protein  26.01 
 
 
382 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.157741  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
305 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>