39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0515 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  407  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  50 
 
 
209 aa  184  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  39.32 
 
 
210 aa  128  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  35.12 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  36.82 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  38.76 
 
 
216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  34.26 
 
 
249 aa  108  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  36.15 
 
 
245 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  34.78 
 
 
393 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  36.57 
 
 
255 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  33.02 
 
 
255 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  30.29 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  37.44 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  36.45 
 
 
241 aa  89.4  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  39.13 
 
 
211 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  37.14 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  28.97 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  36.89 
 
 
210 aa  82  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  25.78 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  32.85 
 
 
221 aa  79  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  36.45 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  31.02 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  26.96 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  26.98 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  31.1 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  31.08 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  29.91 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  28.23 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  27.57 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  28.9 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  26.82 
 
 
325 aa  64.7  0.0000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  25 
 
 
254 aa  62  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  25 
 
 
254 aa  62  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  27.92 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  20.18 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  27.01 
 
 
282 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1181  acetyltransferase or hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  32.97 
 
 
268 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.899858  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  20 
 
 
247 aa  42.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  28.5 
 
 
281 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>