47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0601 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  100 
 
 		 268 aa  543  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  57.53 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  55.09 
 
 		 241 aa  234  8e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  53.7 
 
 		 221 aa  219  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  43.87 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  49.76 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  43.75 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  44.23 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  40.09 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  41.31 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  37.5 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  42.11 
 
 		 222 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  36.02 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  36.54 
 
 		 229 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  31.12 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  26.7 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  30.69 
 
 		 393 aa  106  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  31.78 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  31.31 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  30.82 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  35.67 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  26.5 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  31.43 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  29.86 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  32.09 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  26.89 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  27.52 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  26.29 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  26.46 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  30.72 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  25.74 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  26.42 
 
 		 209 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  25 
 
 		 222 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  26.61 
 
 		 382 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  34.65 
 
 		 1878 aa  48.9  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  25.49 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  28.44 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  28.63 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  23.77 
 
 		 324 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 		 437 aa  46.2  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  27.27 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  22.54 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0751  hypothetical protein  31.53 
 
 		 492 aa  43.9  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.870291 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 		 364 aa  43.5  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  26.85 
 
 		 195 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  26.85 
 
 		 195 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  32.69 
 
 		 286 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>