48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1332 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  621  1e-177  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  52.27 
 
 
221 aa  223  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  53.1 
 
 
241 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  52.21 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  45.38 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  48.2 
 
 
268 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  45.97 
 
 
221 aa  179  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  43.66 
 
 
216 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  42.25 
 
 
216 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  45.75 
 
 
222 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  42.52 
 
 
229 aa  156  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  42.86 
 
 
245 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  41.43 
 
 
211 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  35.85 
 
 
393 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  34.63 
 
 
254 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  33.18 
 
 
207 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  31.71 
 
 
247 aa  122  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  34.25 
 
 
254 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  34.25 
 
 
254 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  26.84 
 
 
236 aa  89  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  31.91 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  30.52 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  29.65 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  26.38 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  31.51 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  31.22 
 
 
209 aa  79  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  35.95 
 
 
216 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  26.42 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  30.41 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  27.31 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  31.44 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  30.53 
 
 
209 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  23.72 
 
 
204 aa  59.7  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  33.64 
 
 
210 aa  59.3  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  31.43 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  38.02 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0751  hypothetical protein  32.58 
 
 
492 aa  50.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.870291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  25.91 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  30.47 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  31.11 
 
 
282 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  28.79 
 
 
210 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3739  PGAP1 family protein  33.75 
 
 
415 aa  46.2  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  33.64 
 
 
298 aa  46.2  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  30.17 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  29.35 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  26.61 
 
 
266 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  31.58 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  26.26 
 
 
276 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>