74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2975 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  100 
 
 		 254 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  36.24 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  34.1 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  39.62 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  33.49 
 
 		 216 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  35.32 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  35.14 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  31.12 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  34.78 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  34.86 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  30.99 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  32.09 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  33.49 
 
 		 393 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  35.62 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  33.8 
 
 		 207 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  30.53 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  30.37 
 
 		 222 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  31.6 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  29.17 
 
 		 240 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  32.87 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  31.31 
 
 		 205 aa  92  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  28.77 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  29.73 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  32.89 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  31.25 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  27.91 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  27.91 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  27.01 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  25.87 
 
 		 325 aa  72  0.000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  32.68 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  28.77 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  28.18 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  25.81 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  38.52 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  31.61 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  27.15 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  24.43 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  23.77 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  30.33 
 
 		 276 aa  52  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45579  predicted protein  24.77 
 
 		 366 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  33.64 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  25.94 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  29.57 
 
 		 332 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  33.03 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  31.58 
 
 		 334 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1647  hypothetical protein  24.55 
 
 		 306 aa  45.8  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.559763 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  34.07 
 
 		 361 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1108  hypothetical protein  27.56 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  28.4 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  30.7 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2031  PGAP1 family protein  27.27 
 
 		 442 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  28.23 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  32.48 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.48 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.48 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.48 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.48 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.48 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  28.21 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  42.62 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  31.11 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1661  PGAP1 family protein  28.16 
 
 		 312 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.403655  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 288 aa  42.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1333  hypothetical protein  29.17 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  26.28 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  25.79 
 
 		 294 aa  42  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  28.68 
 
 		 332 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0628  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  28.45 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.96 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  35.53 
 
 		 743 aa  42.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>