24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0628 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0628  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  100 
 
 
270 aa  550  1e-156  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0450  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  57.04 
 
 
275 aa  308  5e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1181  acetyltransferase or hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  48.67 
 
 
268 aa  258  8e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.899858  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  46.42 
 
 
275 aa  254  7e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  24.79 
 
 
217 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  25 
 
 
225 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  32.48 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  29.32 
 
 
282 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  26.19 
 
 
382 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  23.53 
 
 
222 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  31.9 
 
 
309 aa  46.2  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  29.17 
 
 
298 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0189  PGAP1 family protein  27.97 
 
 
784 aa  45.8  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  29.2 
 
 
339 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  34.55 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  26.61 
 
 
200 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  26.61 
 
 
200 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  23.08 
 
 
223 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  26.27 
 
 
203 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  29.92 
 
 
286 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  21.85 
 
 
222 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2031  PGAP1 family protein  30.47 
 
 
442 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  26.2 
 
 
286 aa  42.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  28.45 
 
 
254 aa  42.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>