19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1333 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1333  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  611  9.999999999999999e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1912  hypothetical protein  41.53 
 
 
315 aa  228  7e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0893  esterase, putative  32.99 
 
 
364 aa  132  9e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.227983  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0871  hypothetical protein  31.58 
 
 
364 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  31.25 
 
 
357 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1868  hypothetical protein  28.15 
 
 
312 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.602901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  26.83 
 
 
378 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  35.48 
 
 
743 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  39.29 
 
 
2169 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  27.27 
 
 
207 aa  46.2  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  41.67 
 
 
356 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  36.17 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  33.82 
 
 
217 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1661  PGAP1 family protein  27.83 
 
 
312 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.403655  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0189  PGAP1 family protein  33.33 
 
 
784 aa  43.9  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  25 
 
 
273 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  40.35 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0840  PGAP1 family protein  41.86 
 
 
414 aa  43.5  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00684645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  29.17 
 
 
254 aa  42.7  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>