18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45579 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45579  predicted protein  100 
 
 
366 aa  745    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28582  predicted protein  27.13 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.614483  hitchhiker  0.000000143013 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34949  predicted protein  27.14 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27826  predicted protein  28.17 
 
 
354 aa  62.8  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0179342 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1839  hypothetical protein  27.06 
 
 
246 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.028666 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2742  hypothetical protein  27.32 
 
 
231 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.681774  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1000  hypothetical protein  28.96 
 
 
239 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.621877  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04171  hypothetical protein  26.32 
 
 
197 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0117581  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1504  hypothetical protein  29.59 
 
 
234 aa  49.7  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1214  putative lipase  29.53 
 
 
227 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.132802 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  24.77 
 
 
254 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1410  hypothetical protein  28.22 
 
 
234 aa  47  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414925  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43573  predicted protein  30.77 
 
 
317 aa  46.2  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.021277  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  40.32 
 
 
743 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1536  hypothetical protein  27.61 
 
 
234 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0780813  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  27.57 
 
 
211 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  36.59 
 
 
589 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  29.03 
 
 
192 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>