20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1504 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1504  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  489  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1410  hypothetical protein  75.86 
 
 
234 aa  379  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414925  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1536  hypothetical protein  69.66 
 
 
234 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0780813  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0955  hypothetical protein  68.4 
 
 
251 aa  335  2.9999999999999997e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.486617 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1000  hypothetical protein  65.38 
 
 
239 aa  333  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.621877  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1277  hypothetical protein  62.39 
 
 
234 aa  330  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00102442  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1214  putative lipase  31.14 
 
 
227 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.132802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1213  putative lipase  28.32 
 
 
237 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.137275 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2742  hypothetical protein  29.83 
 
 
231 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.681774  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1839  hypothetical protein  27.75 
 
 
246 aa  101  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.028666 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2900  putative lipase  28.44 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0286742 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15641  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.87 
 
 
236 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74385 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43573  predicted protein  28.51 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.021277  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04171  hypothetical protein  26.92 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0117581  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28582  predicted protein  25.87 
 
 
296 aa  65.1  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.614483  hitchhiker  0.000000143013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0954  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.57 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45579  predicted protein  29.59 
 
 
366 aa  49.7  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1096  hypothetical protein  35.82 
 
 
543 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34949  predicted protein  24.19 
 
 
318 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  25.81 
 
 
285 aa  41.6  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>