55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1839 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1839  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  500  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.028666 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2742  hypothetical protein  58.77 
 
 
231 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.681774  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1213  putative lipase  39.06 
 
 
237 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.137275 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2900  putative lipase  38.81 
 
 
257 aa  141  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0286742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1214  putative lipase  40.44 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.132802 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1000  hypothetical protein  33.04 
 
 
239 aa  128  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.621877  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43573  predicted protein  33.2 
 
 
317 aa  123  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.021277  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0955  hypothetical protein  29.17 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.486617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1277  hypothetical protein  30.67 
 
 
234 aa  108  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00102442  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04171  hypothetical protein  31.25 
 
 
197 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0117581  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15641  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.8 
 
 
236 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74385 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1410  hypothetical protein  29.31 
 
 
234 aa  102  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414925  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1504  hypothetical protein  27.75 
 
 
234 aa  101  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1536  hypothetical protein  28.32 
 
 
234 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0780813  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34949  predicted protein  27.8 
 
 
318 aa  96.7  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27826  predicted protein  30.6 
 
 
354 aa  89.7  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0179342 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28582  predicted protein  29.13 
 
 
296 aa  89.7  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.614483  hitchhiker  0.000000143013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0954  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.14 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45579  predicted protein  27.06 
 
 
366 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  25.91 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0784  PGAP1 family protein  30.26 
 
 
269 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  47.76 
 
 
364 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  46.27 
 
 
364 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  46.27 
 
 
341 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  46.27 
 
 
360 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  46.27 
 
 
360 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  46.27 
 
 
364 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  44.78 
 
 
364 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  44.78 
 
 
364 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  44.78 
 
 
364 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  44.78 
 
 
364 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  44.78 
 
 
364 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  33.33 
 
 
302 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  44.78 
 
 
364 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  37.93 
 
 
276 aa  48.9  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  35.29 
 
 
281 aa  48.5  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  41.79 
 
 
332 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  45.31 
 
 
367 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1275  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  27.47 
 
 
448 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.676872  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  40.3 
 
 
332 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  43.75 
 
 
367 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  43.75 
 
 
367 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  43.75 
 
 
367 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  43.75 
 
 
367 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  43.75 
 
 
367 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  42.19 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  43.75 
 
 
367 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  43.75 
 
 
367 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  42.19 
 
 
365 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  34.12 
 
 
280 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4243  lipase, putative  28.41 
 
 
473 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.48059 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  41.79 
 
 
377 aa  43.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  58.97 
 
 
318 aa  42  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  32.58 
 
 
361 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  31.46 
 
 
282 aa  42  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>