42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0784 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0784  PGAP1 family protein  100 
 
 
269 aa  523  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  47.91 
 
 
281 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  43.05 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  35.29 
 
 
264 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3470  PGAP1 family protein  38.14 
 
 
264 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595037  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1654  hypothetical protein  39.29 
 
 
262 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1818  hypothetical protein  37.56 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100365  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  34.45 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2469  hypothetical protein  36.23 
 
 
248 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505624  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  35.71 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  30.66 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11216  hypothetical protein  33.96 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1764  hypothetical protein  35.02 
 
 
284 aa  85.9  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560768  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3646  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  29.25 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1301  hypothetical protein  34.17 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130537  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  31.73 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1474  hypothetical protein  29.91 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  28.08 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  31.03 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1839  hypothetical protein  30.26 
 
 
246 aa  52.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.028666 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  28.23 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  42 
 
 
351 aa  45.8  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  33.33 
 
 
361 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  29.13 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08481  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  33.33 
 
 
335 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  27.1 
 
 
367 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  27.1 
 
 
367 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  27.1 
 
 
367 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  27.1 
 
 
367 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  27.1 
 
 
367 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  27.1 
 
 
367 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  27.1 
 
 
367 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  35.92 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  29.91 
 
 
364 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  29.91 
 
 
364 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  29.91 
 
 
364 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  29.91 
 
 
364 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  29.91 
 
 
364 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  29.91 
 
 
364 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  30.91 
 
 
364 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>