28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3470 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3470  PGAP1 family protein  100 
 
 		 264 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595037  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11216  hypothetical protein  60 
 
 		 275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1764  hypothetical protein  50.41 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560768  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  49.57 
 
 		 263 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  44.72 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  47.46 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  45.54 
 
 		 282 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1654  hypothetical protein  46.37 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1301  hypothetical protein  48.98 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130537  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1474  hypothetical protein  45.18 
 
 		 265 aa  188  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  45.54 
 
 		 284 aa  188  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1818  hypothetical protein  47.44 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3646  hypothetical protein  47.44 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2469  hypothetical protein  46.44 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505624  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  41.46 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  38.38 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0784  PGAP1 family protein  38.14 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  33.5 
 
 		 281 aa  92.4  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  32.08 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  34 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  30.28 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  26.4 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  28.47 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  26.18 
 
 		 339 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  29.36 
 
 		 264 aa  42.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2086  lysophospholipase L2, putative  33.96 
 
 		 260 aa  42  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>