174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3293 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  92.31 
 
 		 364 aa  687    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  97.8 
 
 		 364 aa  694    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  94.78 
 
 		 364 aa  665    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  100 
 
 		 364 aa  734    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  94.78 
 
 		 364 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  95.05 
 
 		 364 aa  669    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  90.38 
 
 		 364 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  83.79 
 
 		 364 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  84.07 
 
 		 364 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  84.17 
 
 		 360 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  84.17 
 
 		 360 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  84.21 
 
 		 341 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  72.19 
 
 		 367 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  72.5 
 
 		 367 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  72.5 
 
 		 367 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  72.19 
 
 		 367 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  72.19 
 
 		 367 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  72.19 
 
 		 367 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  72.19 
 
 		 367 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  72.19 
 
 		 367 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  70.36 
 
 		 365 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  55.18 
 
 		 377 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  52.89 
 
 		 332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  51.91 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  44.17 
 
 		 317 aa  225  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  45.8 
 
 		 377 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  43.03 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  43.34 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  41.54 
 
 		 309 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  43.17 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  39.31 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  39.02 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  39.75 
 
 		 309 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  43.79 
 
 		 318 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  40.31 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  40.13 
 
 		 305 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  38.25 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  37.54 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 351 aa  186  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  35.28 
 
 		 305 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  36.67 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  35.67 
 
 		 364 aa  168  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  36.76 
 
 		 294 aa  162  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  37.58 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 		 289 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 296 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 296 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 359 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  30.77 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  26.27 
 
 		 561 aa  74.7  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.64 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  38.21 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  29.95 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  33.99 
 
 		 282 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  29.03 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  33.87 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  38.89 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2297  lipase  28.65 
 
 		 688 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  33.61 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2694  triacylglycerol lipase  26.05 
 
 		 681 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2751  triacylglycerol lipase  26.05 
 
 		 681 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.91 
 
 		 313 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  33.06 
 
 		 302 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  34.45 
 
 		 225 aa  53.1  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02710  lipase 2, putative  43.94 
 
 		 587 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  27.89 
 
 		 280 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  33.08 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  29.55 
 
 		 276 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2527  lipase, putative  29.05 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122973  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0303  triacylglycerol lipase  28.32 
 
 		 645 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0310  triacylglycerol lipase  28.32 
 
 		 645 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2744  putative lipase  24.22 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  0.00000452649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  31.82 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2579  putative lipase  28.57 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  33.94 
 
 		 222 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  33.33 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  35.11 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  29.36 
 
 		 308 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0018  lipase, putative  24.71 
 
 		 681 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 287 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  32.26 
 
 		 223 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  31.85 
 
 		 276 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  33.06 
 
 		 311 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2353  lipase  28.57 
 
 		 413 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  33.6 
 
 		 298 aa  49.7  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  36.52 
 
 		 281 aa  49.7  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  31.34 
 
 		 324 aa  49.7  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1839  hypothetical protein  44.78 
 
 		 246 aa  49.7  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.028666 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2388  lipase  25 
 
 		 643 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  30 
 
 		 288 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 284 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1214  putative lipase  42.11 
 
 		 227 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.132802 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.25 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>