81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00660 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  100 
 
 
324 aa  669    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  57.95 
 
 
305 aa  353  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  55.41 
 
 
323 aa  348  7e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  52.37 
 
 
353 aa  341  9e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  54.43 
 
 
309 aa  335  7.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  52.75 
 
 
305 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  52.1 
 
 
339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  54.36 
 
 
305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  50.17 
 
 
311 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  50.5 
 
 
311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  47.44 
 
 
317 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  52.26 
 
 
318 aa  275  6e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  48.45 
 
 
309 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 
351 aa  253  3e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  45.12 
 
 
308 aa  242  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  43.25 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  45.48 
 
 
332 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  45.3 
 
 
332 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  40.13 
 
 
364 aa  212  5.999999999999999e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 
296 aa  202  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  40.19 
 
 
364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  38.94 
 
 
364 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  40.88 
 
 
296 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  40.2 
 
 
296 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  40.27 
 
 
289 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  40.88 
 
 
296 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 
315 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  39.63 
 
 
364 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  39.63 
 
 
360 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  39.63 
 
 
360 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  38.94 
 
 
364 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  38.39 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  38.39 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  38.39 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 
359 aa  189  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  39.82 
 
 
365 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  38.32 
 
 
364 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  36.49 
 
 
377 aa  186  6e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  39.75 
 
 
367 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  39.75 
 
 
367 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  39.75 
 
 
367 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  39.75 
 
 
367 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  39.75 
 
 
367 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  39.75 
 
 
367 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  39.75 
 
 
367 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  38.7 
 
 
294 aa  178  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  38.51 
 
 
367 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  38.04 
 
 
364 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  38.81 
 
 
341 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  33.97 
 
 
377 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  28.4 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  30.09 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  29.17 
 
 
414 aa  63.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  26.14 
 
 
561 aa  63.2  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.62 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  25.9 
 
 
394 aa  56.2  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  32.46 
 
 
357 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  35.48 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  29.75 
 
 
286 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2527  lipase, putative  30.94 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2353  lipase  30.94 
 
 
413 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  32.77 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2663  putative lipase  30.94 
 
 
413 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00815188  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  31.18 
 
 
225 aa  47  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2625  lipase, putative  30.94 
 
 
413 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0056265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2387  lipase (triacylglycerol lipase)  30.22 
 
 
413 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.222994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2744  putative lipase  30.5 
 
 
413 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  0.00000452649 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2624  putative lipase  30.22 
 
 
413 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000276049 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2579  putative lipase  30.22 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  28.42 
 
 
281 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  27.42 
 
 
260 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  28.41 
 
 
281 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2432  lipase  28.37 
 
 
400 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0455376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  30.12 
 
 
276 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  23.13 
 
 
255 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.06 
 
 
370 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  25.34 
 
 
222 aa  43.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  23.13 
 
 
255 aa  43.1  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  29.77 
 
 
257 aa  42.7  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  27.42 
 
 
283 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  31.82 
 
 
294 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>