60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2297 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2751  triacylglycerol lipase  61.36 
 
 
681 aa  822    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2297  lipase  100 
 
 
688 aa  1413    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2336  lipase, putative  50.13 
 
 
728 aa  645    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2694  triacylglycerol lipase  61.36 
 
 
681 aa  822    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0018  lipase, putative  43.08 
 
 
681 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2388  lipase  39.79 
 
 
643 aa  481  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0310  triacylglycerol lipase  39.97 
 
 
645 aa  475  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0303  triacylglycerol lipase  39.97 
 
 
645 aa  475  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2387  lipase (triacylglycerol lipase)  40.62 
 
 
413 aa  259  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.222994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2624  putative lipase  40.62 
 
 
413 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000276049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2625  lipase, putative  40.47 
 
 
413 aa  256  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0056265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2663  putative lipase  40.47 
 
 
413 aa  256  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00815188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2353  lipase  40.78 
 
 
413 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2432  lipase  40.36 
 
 
400 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0455376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2744  putative lipase  39.85 
 
 
413 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  0.00000452649 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2579  putative lipase  39.85 
 
 
413 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2527  lipase, putative  39.07 
 
 
413 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122973  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2819  Triacylglycerol lipase  35.57 
 
 
416 aa  211  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  23.38 
 
 
332 aa  64.3  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  23.94 
 
 
332 aa  61.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  24.73 
 
 
377 aa  60.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  29.73 
 
 
364 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  32 
 
 
1153 aa  57.8  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  32 
 
 
1153 aa  57.8  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  27.62 
 
 
561 aa  57  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  28.65 
 
 
364 aa  55.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  28.11 
 
 
341 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  28.65 
 
 
364 aa  55.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  28.11 
 
 
364 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  28.11 
 
 
360 aa  55.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  28.11 
 
 
360 aa  55.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  27.57 
 
 
364 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  28.11 
 
 
364 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  28.11 
 
 
364 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  28.11 
 
 
364 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  28.49 
 
 
367 aa  51.6  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  28.49 
 
 
367 aa  51.6  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  28.49 
 
 
367 aa  51.6  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  27.17 
 
 
364 aa  51.2  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
323 aa  49.3  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2521  cell wall anchor domain-containing protein  31 
 
 
987 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2573  cell wall anchor domain-containing protein  31 
 
 
987 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  26.2 
 
 
309 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  26.74 
 
 
367 aa  48.5  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  27.91 
 
 
367 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  27.91 
 
 
367 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  27.91 
 
 
367 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  27.91 
 
 
367 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2710  cell wall anchor domain-containing protein  46.51 
 
 
877 aa  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
365 aa  48.5  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2654  cell wall anchor domain-containing protein  46.51 
 
 
877 aa  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  28.73 
 
 
2397 aa  47.8  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0719  cell wall surface anchor family protein  51.72 
 
 
824 aa  47  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000554603  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0576  hypothetical protein  30.89 
 
 
996 aa  47.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
305 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  25.75 
 
 
309 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 
305 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  38.75 
 
 
1337 aa  45.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  38.75 
 
 
1337 aa  45.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  25.44 
 
 
305 aa  44.7  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>