89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3849 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 323 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  70.43 
 
 		 305 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  66.23 
 
 		 305 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  56.63 
 
 		 309 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  59.08 
 
 		 339 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  55.41 
 
 		 324 aa  348  6e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  59.64 
 
 		 353 aa  348  6e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  59.93 
 
 		 305 aa  335  9e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  58.31 
 
 		 318 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  52.08 
 
 		 311 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  52.04 
 
 		 317 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  51.44 
 
 		 311 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  51.57 
 
 		 309 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  49.48 
 
 		 309 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  45.67 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  46.23 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  43 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  41.53 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  42.51 
 
 		 289 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 		 377 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  43 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  38.29 
 
 		 359 aa  192  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  39.76 
 
 		 364 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  39.52 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  41.1 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  38.84 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  41.44 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  38.91 
 
 		 364 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  38.87 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  41.44 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  38.87 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  38.87 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  38.99 
 
 		 364 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  39.62 
 
 		 364 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  38.99 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  38.99 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  41.1 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  39.81 
 
 		 367 aa  179  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  39.12 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  39.12 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  39.12 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  39.12 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  39.12 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  39.12 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  39.12 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  37.74 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  37.35 
 
 		 364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  38.43 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  32.23 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.59 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  30.99 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  38.02 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  25.74 
 
 		 561 aa  60.5  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  26.43 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2353  lipase  28.47 
 
 		 413 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2579  putative lipase  27.7 
 
 		 413 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2527  lipase, putative  27.03 
 
 		 413 aa  52.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122973  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  30.43 
 
 		 225 aa  52.8  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2744  putative lipase  28.38 
 
 		 413 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  0.00000452649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  39.76 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  27.34 
 
 		 394 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2625  lipase, putative  27.7 
 
 		 413 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0056265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2663  putative lipase  27.7 
 
 		 413 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00815188  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0310  triacylglycerol lipase  28.24 
 
 		 645 aa  50.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0303  triacylglycerol lipase  28.24 
 
 		 645 aa  50.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2336  lipase, putative  28.18 
 
 		 728 aa  49.7  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2297  lipase  29.2 
 
 		 688 aa  49.3  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2624  putative lipase  27.08 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000276049 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2387  lipase (triacylglycerol lipase)  26.35 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.222994  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33438  predicted protein  25.09 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.163153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2694  triacylglycerol lipase  27.06 
 
 		 681 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  28.81 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2751  triacylglycerol lipase  27.06 
 
 		 681 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  38.3 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  34.23 
 
 		 283 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  27.83 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  37.63 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  37.63 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2432  lipase  26.43 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0455376  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  32.43 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5996  hypothetical protein  31.43 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  33.04 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  26.67 
 
 		 222 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5547  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  35.11 
 
 		 286 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  32.26 
 
 		 262 aa  42.7  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 		 260 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>