16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5996 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5996  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  759    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2927  hypothetical protein  38.03 
 
 
422 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.423308 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3068  hypothetical protein  37.77 
 
 
380 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3176  hypothetical protein  37.77 
 
 
380 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.649914  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2978  hypothetical protein  37.23 
 
 
382 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.157741  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  26.2 
 
 
357 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.09 
 
 
273 aa  61.6  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  33.6 
 
 
309 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  33.59 
 
 
309 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  26.75 
 
 
339 aa  50.4  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  32.64 
 
 
561 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  27.86 
 
 
414 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
377 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 
305 aa  43.9  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.75 
 
 
286 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>