56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2336 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2297  lipase  50.13 
 
 		 688 aa  645    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2336  lipase, putative  100 
 
 		 728 aa  1496    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2694  triacylglycerol lipase  48.15 
 
 		 681 aa  634  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2751  triacylglycerol lipase  48.15 
 
 		 681 aa  634  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0018  lipase, putative  38.67 
 
 		 681 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0310  triacylglycerol lipase  37.81 
 
 		 645 aa  433  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0303  triacylglycerol lipase  37.81 
 
 		 645 aa  433  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2388  lipase  36.73 
 
 		 643 aa  416  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2624  putative lipase  39.33 
 
 		 413 aa  243  9e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000276049 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2387  lipase (triacylglycerol lipase)  39.33 
 
 		 413 aa  243  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.222994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2353  lipase  39.07 
 
 		 413 aa  243  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2663  putative lipase  39.07 
 
 		 413 aa  242  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00815188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2625  lipase, putative  39.07 
 
 		 413 aa  242  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0056265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2744  putative lipase  38.66 
 
 		 413 aa  241  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  0.00000452649 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2432  lipase  39.07 
 
 		 400 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0455376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2579  putative lipase  38.56 
 
 		 413 aa  239  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2527  lipase, putative  38.05 
 
 		 413 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122973  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2819  Triacylglycerol lipase  37.4 
 
 		 416 aa  194  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  28.89 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  30.59 
 
 		 332 aa  62  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  30.59 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  29.48 
 
 		 367 aa  50.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  29.48 
 
 		 367 aa  50.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  29.48 
 
 		 367 aa  50.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  27.07 
 
 		 561 aa  50.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  29.03 
 
 		 364 aa  50.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 		 377 aa  49.7  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 323 aa  49.7  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  29.48 
 
 		 367 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  29.48 
 
 		 367 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  29.48 
 
 		 367 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  29.48 
 
 		 367 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  26.77 
 
 		 309 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  28.16 
 
 		 364 aa  48.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  28.16 
 
 		 364 aa  47.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  28.32 
 
 		 367 aa  47.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  28.16 
 
 		 360 aa  47.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  28.16 
 
 		 364 aa  47.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  28.16 
 
 		 360 aa  47.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  28.25 
 
 		 341 aa  47.4  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0719  cell wall surface anchor family protein  55.88 
 
 		 824 aa  47.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000554603  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  27 
 
 		 364 aa  47.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  24.87 
 
 		 309 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  28.16 
 
 		 364 aa  47.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2573  cell wall anchor domain-containing protein  31.82 
 
 		 987 aa  45.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2521  cell wall anchor domain-containing protein  31.82 
 
 		 987 aa  45.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  27.59 
 
 		 364 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  27.59 
 
 		 364 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  27.59 
 
 		 364 aa  45.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  25.71 
 
 		 2402 aa  45.4  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  33.8 
 
 		 1153 aa  45.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  33.8 
 
 		 1153 aa  45.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 305 aa  44.7  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  38.89 
 
 		 1337 aa  44.3  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  36.36 
 
 		 2397 aa  44.3  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  38.89 
 
 		 1337 aa  44.3  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>