77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3358 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  100 
 
 		 305 aa  609  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  63.84 
 
 		 339 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  60.59 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  59.74 
 
 		 309 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  61.06 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  61.94 
 
 		 317 aa  368  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  61.06 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  63.33 
 
 		 318 aa  348  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  59.21 
 
 		 323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  56.07 
 
 		 305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  55.7 
 
 		 305 aa  316  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  53.31 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  54.14 
 
 		 324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  53.52 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  49.67 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  44.26 
 
 		 351 aa  247  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  45.34 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  45.75 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  45.21 
 
 		 332 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  46.39 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  47.1 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  46.74 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  46.74 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  45.7 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  44.52 
 
 		 289 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  41.96 
 
 		 364 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  40.92 
 
 		 364 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  41.38 
 
 		 294 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  40.31 
 
 		 364 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  40.31 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  40.31 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  40.31 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  42.06 
 
 		 364 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  42.06 
 
 		 360 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  42.06 
 
 		 360 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  38.73 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  41.1 
 
 		 359 aa  193  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  42.3 
 
 		 364 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  40.62 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  37.93 
 
 		 377 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  39.56 
 
 		 367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  39.56 
 
 		 367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  39.56 
 
 		 367 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  39.56 
 
 		 367 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  39.56 
 
 		 367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  39.56 
 
 		 367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  39.56 
 
 		 367 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 		 377 aa  175  8e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  41.7 
 
 		 341 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  35.53 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  31.02 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  28.26 
 
 		 561 aa  68.9  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  29.38 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.54 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  30.38 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  33.07 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  28.37 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  30.66 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  35.4 
 
 		 281 aa  49.3  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  34.78 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  34.34 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  31.4 
 
 		 217 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  23.76 
 
 		 260 aa  45.8  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  29.41 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.46 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  32.61 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2751  triacylglycerol lipase  30.47 
 
 		 681 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2297  lipase  25.44 
 
 		 688 aa  43.9  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2694  triacylglycerol lipase  30.47 
 
 		 681 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1272  hypothetical protein  36.44 
 
 		 450 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  31.67 
 
 		 283 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  33.66 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02710  lipase 2, putative  31.09 
 
 		 587 aa  42.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  32.94 
 
 		 281 aa  42.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  28.44 
 
 		 225 aa  42.4  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>