79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4911 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 296 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  95.95 
 
 		 315 aa  583  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  96.28 
 
 		 296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  94.59 
 
 		 296 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  73.99 
 
 		 296 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  52.36 
 
 		 294 aa  271  8.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  49.83 
 
 		 289 aa  248  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  46.05 
 
 		 311 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  46.78 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  45.36 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  46.39 
 
 		 305 aa  218  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  43.99 
 
 		 339 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  43 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  43.34 
 
 		 309 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  42.47 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  41.78 
 
 		 353 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  40.2 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  40.89 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  41.44 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  43.3 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 351 aa  178  8e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  39.39 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  38.13 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  38.33 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  36.92 
 
 		 364 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  36.92 
 
 		 360 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  36.92 
 
 		 360 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  36.65 
 
 		 364 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  36.68 
 
 		 364 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  35.2 
 
 		 364 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  35.71 
 
 		 364 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  35.71 
 
 		 364 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  35.2 
 
 		 364 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  35.71 
 
 		 364 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  34.28 
 
 		 377 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  35.95 
 
 		 359 aa  142  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  36.34 
 
 		 364 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  35.45 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  36.02 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  36.02 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  36.02 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  36.02 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  36.02 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  36.02 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  36.02 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  36.02 
 
 		 367 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  35.26 
 
 		 377 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  35.54 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  36.22 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  26.23 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  31.65 
 
 		 414 aa  62.4  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  26.74 
 
 		 561 aa  62.4  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.44 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  35.09 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  26.37 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  35.19 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  31.11 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  25.22 
 
 		 222 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  33.62 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  32.77 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  31.87 
 
 		 276 aa  46.6  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  32.76 
 
 		 298 aa  46.2  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  35.21 
 
 		 278 aa  45.8  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  27.03 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  27.12 
 
 		 225 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37370  predicted protein  27.5 
 
 		 314 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.273183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  35.56 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  31.37 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2686  alpha/beta hydrolase fold protein  38.3 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.698481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.86 
 
 		 370 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78871  predicted protein  43.48 
 
 		 114 aa  43.1  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  41.51 
 
 		 357 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  41.51 
 
 		 357 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  39.62 
 
 		 357 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  40 
 
 		 217 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  34.07 
 
 		 286 aa  42.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  29.91 
 
 		 280 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2422  alpha/beta fold family hydrolase  46.81 
 
 		 343 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.157324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>