79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02696 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  719    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  87.38 
 
 
309 aa  552  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  74.92 
 
 
339 aa  463  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  62.54 
 
 
305 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  62.03 
 
 
318 aa  350  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  59.64 
 
 
323 aa  348  7e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  58.62 
 
 
317 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  54.46 
 
 
305 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  57.89 
 
 
311 aa  335  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  56.99 
 
 
305 aa  335  5e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  52.37 
 
 
324 aa  335  5.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  57.19 
 
 
311 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  52.26 
 
 
309 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  51.45 
 
 
308 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  50.17 
 
 
309 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  46.21 
 
 
351 aa  255  7e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  47.64 
 
 
332 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  46.84 
 
 
332 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  44.55 
 
 
364 aa  228  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  43.19 
 
 
364 aa  226  4e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  41.62 
 
 
359 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  43.96 
 
 
364 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  43.83 
 
 
364 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  43.65 
 
 
364 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  43.65 
 
 
364 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  43.65 
 
 
364 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  43.34 
 
 
364 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  44.56 
 
 
296 aa  209  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  42.72 
 
 
364 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  42.72 
 
 
360 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  42.72 
 
 
360 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  42.96 
 
 
294 aa  206  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  43.15 
 
 
296 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 
289 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  41.18 
 
 
367 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  38.94 
 
 
377 aa  203  4e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  40.56 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  39.94 
 
 
365 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  40.56 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  40.56 
 
 
367 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  40.56 
 
 
367 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  40.56 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  40.56 
 
 
367 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  40.56 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  42.99 
 
 
364 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  41.78 
 
 
296 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  41.78 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  41.78 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  40.57 
 
 
377 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  40.42 
 
 
341 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  32.32 
 
 
299 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  32.02 
 
 
414 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  28.76 
 
 
561 aa  75.1  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  29.58 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  35.66 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.1 
 
 
286 aa  56.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  26.22 
 
 
394 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2527  lipase, putative  30.5 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2579  putative lipase  30.28 
 
 
413 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  28.47 
 
 
276 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2744  putative lipase  30.99 
 
 
413 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  0.00000452649 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0018  lipase, putative  24.41 
 
 
681 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  35.71 
 
 
293 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  32.65 
 
 
282 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2353  lipase  29.63 
 
 
413 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2387  lipase (triacylglycerol lipase)  28.17 
 
 
413 aa  46.6  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.222994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2663  putative lipase  28.28 
 
 
413 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00815188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2625  lipase, putative  28.28 
 
 
413 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0056265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2432  lipase  29.57 
 
 
400 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0455376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2624  putative lipase  29.57 
 
 
413 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000276049 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  35.87 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  37.78 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  29.3 
 
 
281 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  27.59 
 
 
225 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  32.97 
 
 
286 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  34.07 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  28.95 
 
 
281 aa  43.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  33.7 
 
 
282 aa  42.7  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  29.17 
 
 
283 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>