61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0949 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  100 
 
 
414 aa  846    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  52.63 
 
 
367 aa  325  9e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  29.52 
 
 
339 aa  82  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  31.76 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  32.02 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  26.43 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  33.59 
 
 
309 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  30 
 
 
309 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  27.39 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  31.95 
 
 
311 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  28.02 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  33.8 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  31.61 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 
296 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  33.64 
 
 
324 aa  63.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
296 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
296 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
315 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  32.31 
 
 
332 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  28.87 
 
 
305 aa  62.4  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  31.37 
 
 
367 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  30.07 
 
 
332 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  29.68 
 
 
364 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  30.13 
 
 
364 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  30.13 
 
 
364 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  30.13 
 
 
364 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  29.88 
 
 
367 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  29.88 
 
 
367 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  29.01 
 
 
367 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  30.32 
 
 
367 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  27.78 
 
 
364 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
364 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  29.01 
 
 
367 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  29.01 
 
 
367 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  29.01 
 
 
367 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  30.5 
 
 
294 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  28.48 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  28.48 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  29.03 
 
 
364 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
296 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  28.83 
 
 
364 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  28.48 
 
 
341 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  28.48 
 
 
364 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  32.58 
 
 
357 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  31.02 
 
 
561 aa  56.6  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  29.93 
 
 
364 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
289 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  27.43 
 
 
299 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 
377 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  27.51 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
359 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.47 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5996  hypothetical protein  27.86 
 
 
374 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  23.83 
 
 
378 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  34.25 
 
 
743 aa  44.3  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.8 
 
 
273 aa  43.1  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>