74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0571 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 296 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  73.99 
 
 		 296 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  73.99 
 
 		 296 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  73.31 
 
 		 315 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  73.65 
 
 		 296 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  51.35 
 
 		 294 aa  272  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  47.14 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  45.7 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  45.02 
 
 		 311 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  45.42 
 
 		 317 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  45.39 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  45.7 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  42.76 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  42.96 
 
 		 309 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  44.56 
 
 		 353 aa  209  7e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  43.88 
 
 		 309 aa  208  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  42.81 
 
 		 305 aa  203  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  42.66 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  43 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  44.37 
 
 		 318 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  38.51 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  40.07 
 
 		 332 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  39.53 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  37.58 
 
 		 364 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  37.58 
 
 		 364 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  37.58 
 
 		 364 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  37.58 
 
 		 364 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  36.88 
 
 		 364 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  37.58 
 
 		 364 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  37.58 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  36.96 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  36.96 
 
 		 360 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  36.96 
 
 		 360 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 		 377 aa  156  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  35.98 
 
 		 359 aa  155  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  37.58 
 
 		 367 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  36.65 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  36.65 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  36.65 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  36.65 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  36.65 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  36.65 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  36.65 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  37.5 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 364 aa  152  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  37.27 
 
 		 364 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  39.94 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  33.97 
 
 		 377 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  35.66 
 
 		 341 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  29.53 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  27.11 
 
 		 394 aa  67  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.68 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  27.27 
 
 		 561 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  37.07 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  32.81 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  34.31 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  29.75 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  28.91 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  44.44 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  29.58 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  25.81 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  27.59 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  35.56 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  29.91 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  35.29 
 
 		 281 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  34.07 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  42.25 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  33.9 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  31.09 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  37.33 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  36.36 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2927  hypothetical protein  30.65 
 
 		 422 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.423308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  33.61 
 
 		 269 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>