137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0764 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  100 
 
 
222 aa  454  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  86.49 
 
 
222 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  52.25 
 
 
223 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  54.36 
 
 
217 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  55 
 
 
225 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  42.45 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  34.93 
 
 
281 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  33.66 
 
 
276 aa  111  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  32.9 
 
 
286 aa  98.6  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  33.33 
 
 
281 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  32.5 
 
 
283 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  32.24 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  28.57 
 
 
282 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  31.19 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  27.32 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  28.41 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5451  lipase class 2  28.78 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1272  hypothetical protein  30.95 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  28 
 
 
314 aa  71.6  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  24.49 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  26.34 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  26.34 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  24.55 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  23.33 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  29.14 
 
 
299 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  27.17 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  27.87 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4818  lipase class 2  28.49 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  29.25 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  27.03 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  29.61 
 
 
342 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  27.17 
 
 
302 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4243  lipase, putative  37.14 
 
 
473 aa  62  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.48059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  25.9 
 
 
313 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  26.92 
 
 
304 aa  62  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  24.59 
 
 
276 aa  61.6  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  23.57 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  26.88 
 
 
200 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  26.25 
 
 
334 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  26.88 
 
 
200 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  28 
 
 
287 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  21.47 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  28.57 
 
 
287 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1275  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  30.94 
 
 
448 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.676872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  28.57 
 
 
287 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  24.32 
 
 
294 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
289 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1057  lipase, class 2  28.86 
 
 
235 aa  56.6  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.24448  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0277  hypothetical protein  28.82 
 
 
454 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  26.77 
 
 
303 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  26.32 
 
 
430 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  26.77 
 
 
303 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  31.39 
 
 
364 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  33.33 
 
 
364 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  23.03 
 
 
356 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2701  lipase, class 2  25.51 
 
 
573 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  22.1 
 
 
197 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1661  PGAP1 family protein  23.56 
 
 
312 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.403655  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  31.45 
 
 
332 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4601  hypothetical protein  29.2 
 
 
304 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  30.69 
 
 
332 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  24.39 
 
 
313 aa  52.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.05 
 
 
286 aa  52  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2050  hypothetical protein  28.41 
 
 
436 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  22.01 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
315 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  31.87 
 
 
364 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0661  hypothetical protein  30.63 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  34.07 
 
 
364 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  28.74 
 
 
309 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  34.07 
 
 
364 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  24.12 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  31.87 
 
 
341 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  31.87 
 
 
360 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  31.87 
 
 
360 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  29.57 
 
 
299 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  34.07 
 
 
364 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  33.33 
 
 
364 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0117  twin-arginine translocation pathway signal  30.51 
 
 
457 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  25.97 
 
 
289 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  23.86 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 
296 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  28.78 
 
 
364 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3530  hypothetical protein  27.27 
 
 
368 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  27.11 
 
 
332 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  25.22 
 
 
296 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  22.39 
 
 
339 aa  49.3  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  29.66 
 
 
305 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
305 aa  49.3  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1553  lipase class 2  32.38 
 
 
307 aa  48.9  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129405  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
296 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  22.1 
 
 
197 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0281  hypothetical protein  28.75 
 
 
432 aa  48.5  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  31.87 
 
 
364 aa  48.5  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  25 
 
 
203 aa  48.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  22.78 
 
 
309 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  34.07 
 
 
263 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1130  hypothetical protein  34.25 
 
 
468 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00209773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  28.95 
 
 
318 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>