140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0739 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  100 
 
 
332 aa  667    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  95.48 
 
 
332 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  54.71 
 
 
364 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  52.49 
 
 
364 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  54.23 
 
 
364 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  54.23 
 
 
360 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  54.23 
 
 
360 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  53.61 
 
 
364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  53.92 
 
 
364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  52.98 
 
 
364 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  52.98 
 
 
364 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  52.98 
 
 
364 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  53.31 
 
 
364 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  51.54 
 
 
367 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  51.54 
 
 
367 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  50.31 
 
 
367 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  51.23 
 
 
367 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  51.23 
 
 
367 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  51.23 
 
 
367 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  51.23 
 
 
367 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  51.23 
 
 
367 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  50.91 
 
 
365 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  48.01 
 
 
377 aa  266  4e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  48.93 
 
 
377 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  51.59 
 
 
341 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  46.39 
 
 
317 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  50.83 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  45.57 
 
 
311 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  44.08 
 
 
311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  47.64 
 
 
353 aa  233  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  45.16 
 
 
339 aa  232  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  46.51 
 
 
309 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  45.42 
 
 
305 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  45.12 
 
 
351 aa  229  5e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  43.94 
 
 
324 aa  229  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  44.55 
 
 
308 aa  228  9e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  44.3 
 
 
309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  43.46 
 
 
305 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  43.67 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  42.54 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 
323 aa  210  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  40.33 
 
 
364 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
296 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  37.96 
 
 
315 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  38.13 
 
 
296 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 
296 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 
296 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  38.01 
 
 
289 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  37.84 
 
 
294 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  32.88 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  31.77 
 
 
561 aa  96.7  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.37 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  29.05 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  31.65 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2297  lipase  22.65 
 
 
688 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0303  triacylglycerol lipase  30.26 
 
 
645 aa  66.6  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0310  triacylglycerol lipase  30.26 
 
 
645 aa  66.6  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2694  triacylglycerol lipase  23.95 
 
 
681 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2751  triacylglycerol lipase  23.95 
 
 
681 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  27.34 
 
 
394 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2336  lipase, putative  30.59 
 
 
728 aa  62  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2527  lipase, putative  29.9 
 
 
413 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122973  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  31.71 
 
 
222 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  30.14 
 
 
414 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  32.79 
 
 
223 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2625  lipase, putative  30.41 
 
 
413 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0056265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2663  putative lipase  30.41 
 
 
413 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00815188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2624  putative lipase  30.16 
 
 
413 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000276049 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2387  lipase (triacylglycerol lipase)  30.48 
 
 
413 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.222994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2432  lipase  30.27 
 
 
400 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0455376  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0018  lipase, putative  25.94 
 
 
681 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  40.18 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  35.11 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2353  lipase  30.72 
 
 
413 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2744  putative lipase  30 
 
 
413 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  0.00000452649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  30.56 
 
 
285 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2579  putative lipase  28.35 
 
 
413 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2388  lipase  28.16 
 
 
643 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  31.62 
 
 
225 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  33.33 
 
 
280 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2532  PGAP1 family protein  26.9 
 
 
547 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.990857  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  30.66 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1214  putative lipase  38 
 
 
227 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.132802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  34.29 
 
 
264 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2303  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
300 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  29.03 
 
 
217 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78871  predicted protein  52 
 
 
114 aa  50.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  33.08 
 
 
282 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  25.98 
 
 
276 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  32.23 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  33.7 
 
 
286 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02710  lipase 2, putative  31.97 
 
 
587 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  28.33 
 
 
275 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  29.53 
 
 
283 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  35 
 
 
281 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  35.9 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.45 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  31.96 
 
 
302 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  28.7 
 
 
276 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>