82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1098 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 305 aa  634    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  70.43 
 
 		 323 aa  454  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  63.61 
 
 		 305 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  57.95 
 
 		 324 aa  351  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  58.56 
 
 		 309 aa  345  5e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  59.57 
 
 		 339 aa  345  5e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  56.99 
 
 		 353 aa  335  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  58.57 
 
 		 305 aa  332  6e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  57.35 
 
 		 318 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  48.68 
 
 		 311 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  48.01 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  51.59 
 
 		 317 aa  295  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  50.85 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 		 351 aa  255  5e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  46.13 
 
 		 309 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  46.67 
 
 		 308 aa  241  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  43.96 
 
 		 364 aa  232  5e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  42.96 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  42.96 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  42.81 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 		 289 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  40.89 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  40.89 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  38.75 
 
 		 294 aa  188  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  40.55 
 
 		 296 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  36.45 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  36.14 
 
 		 364 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  34.39 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  36.16 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  35.83 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  35.83 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  35.83 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  36.25 
 
 		 364 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  35.62 
 
 		 364 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  35.62 
 
 		 360 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  35.62 
 
 		 360 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  38.15 
 
 		 367 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 365 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  37.38 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  37.38 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  37.38 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  37.38 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  37.38 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  37.38 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  37.38 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  37.19 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  35.87 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  35.46 
 
 		 341 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  33.09 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.92 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  33.33 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  38.32 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  28.14 
 
 		 561 aa  60.1  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  26.57 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  32.23 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0018  lipase, putative  25.24 
 
 		 681 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  29.55 
 
 		 222 aa  49.3  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  29.51 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0303  triacylglycerol lipase  28.32 
 
 		 645 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0310  triacylglycerol lipase  28.32 
 
 		 645 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2744  putative lipase  25.83 
 
 		 413 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  0.00000452649 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  31.39 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  29.75 
 
 		 282 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2297  lipase  28.47 
 
 		 688 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  32.5 
 
 		 286 aa  46.2  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2751  triacylglycerol lipase  25.13 
 
 		 681 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2694  triacylglycerol lipase  25.13 
 
 		 681 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  29.45 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  29.17 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2336  lipase, putative  25.08 
 
 		 728 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  31.86 
 
 		 222 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5996  hypothetical protein  32.61 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2353  lipase  25 
 
 		 413 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02710  lipase 2, putative  29.71 
 
 		 587 aa  43.9  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  27.27 
 
 		 280 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2527  lipase, putative  24.5 
 
 		 413 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122973  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1214  putative lipase  35 
 
 		 227 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.132802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  28.03 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  29.33 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>