75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2564 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  100 
 
 		 317 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  77.43 
 
 		 311 aa  474  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  76.8 
 
 		 311 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  60.25 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  61.94 
 
 		 305 aa  368  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  58.62 
 
 		 353 aa  338  8e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  58.42 
 
 		 309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  57.79 
 
 		 309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  59.72 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  52.22 
 
 		 305 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  53.47 
 
 		 309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  52.04 
 
 		 323 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  51.59 
 
 		 305 aa  295  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  47.12 
 
 		 324 aa  268  8e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  46.18 
 
 		 364 aa  256  3e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  47.73 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  48.3 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  47.81 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  43.17 
 
 		 364 aa  229  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  46.78 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  43.87 
 
 		 364 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  46.78 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  43.87 
 
 		 364 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  46.78 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  42.94 
 
 		 364 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  46.78 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 		 296 aa  222  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  43.34 
 
 		 364 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  43.34 
 
 		 364 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  43.34 
 
 		 364 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  43.34 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  43.34 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  43.34 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  42.41 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  42.11 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  42.11 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  42.11 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  42.11 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  42.11 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  42.11 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  42.11 
 
 		 367 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  44.71 
 
 		 294 aa  215  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  43.48 
 
 		 365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  42.47 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  43.96 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  41.11 
 
 		 289 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 		 377 aa  196  6e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  39.32 
 
 		 377 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  41.61 
 
 		 341 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  31.97 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  28.08 
 
 		 561 aa  80.5  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  29.85 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  29.95 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  28.77 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  25 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  25.81 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2579  putative lipase  26.79 
 
 		 413 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2527  lipase, putative  25 
 
 		 413 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  27.78 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2625  lipase, putative  25.6 
 
 		 413 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0056265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2663  putative lipase  25.6 
 
 		 413 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00815188  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  36.96 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2353  lipase  25 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2744  putative lipase  27.27 
 
 		 413 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  0.00000452649 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  39.66 
 
 		 216 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2624  putative lipase  25 
 
 		 413 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000276049 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2387  lipase (triacylglycerol lipase)  25 
 
 		 413 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.222994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2432  lipase  26.79 
 
 		 400 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0455376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  29.6 
 
 		 281 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3156  hypothetical protein  30.34 
 
 		 533 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.147109 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.6 
 
 		 273 aa  43.1  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  31.9 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 327 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>