55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1144 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
359 aa  743    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  42.13 
 
 
309 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  43.1 
 
 
339 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  41.62 
 
 
353 aa  223  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  45.54 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  45.23 
 
 
311 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  44.11 
 
 
317 aa  215  9e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  41.67 
 
 
305 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  38.95 
 
 
323 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  40.73 
 
 
305 aa  190  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  41.36 
 
 
318 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  38.38 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  39.32 
 
 
309 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  35.5 
 
 
351 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  37.31 
 
 
296 aa  160  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  35.95 
 
 
309 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  36.34 
 
 
364 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 
296 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  34.63 
 
 
308 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 
296 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  33.85 
 
 
332 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 
315 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  33.23 
 
 
332 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  34.04 
 
 
364 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  33.71 
 
 
364 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  33.14 
 
 
364 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  32.74 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  32.76 
 
 
364 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  32.76 
 
 
364 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  32.76 
 
 
364 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  32.52 
 
 
294 aa  130  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  31.55 
 
 
364 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 
365 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 
289 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  31.14 
 
 
364 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  31.14 
 
 
360 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  31.14 
 
 
360 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  31.91 
 
 
367 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  33.24 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  33.24 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  33.24 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  33.24 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  33.24 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  33.24 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  33.24 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  32.66 
 
 
377 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  29.39 
 
 
341 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  34.06 
 
 
367 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  35.92 
 
 
299 aa  59.3  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  27.53 
 
 
357 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  24.83 
 
 
414 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  26.43 
 
 
276 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>