More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5547 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5547  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
297 aa  603  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5789  alpha/beta hydrolase fold protein  35.14 
 
 
306 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.0718304 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2686  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 
310 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.698481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1006  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17930  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.94 
 
 
330 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5387  alpha/beta hydrolase  41.73 
 
 
290 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3473  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 
323 aa  99.8  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5013  carboxylesterase Na  26.87 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257907  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.82 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.91 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.71 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1827  hydrolase  33.54 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.99 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.71 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.71 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3471  alpha/beta hydrolase  34.84 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.82 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.09 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.82 
 
 
371 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.81 
 
 
370 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38 
 
 
369 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.05 
 
 
374 aa  63.5  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  38.94 
 
 
474 aa  62.4  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2694  alpha/beta fold family hydrolase  24.18 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00231525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 
352 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1509  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000127113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.36 
 
 
372 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.5 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.5 
 
 
368 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.5 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5749  Alpha/beta hydrolase  35.29 
 
 
408 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03491  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  33.66 
 
 
562 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
304 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4023  alpha/beta hydrolase fold protein  32.19 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.14 
 
 
371 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  32.82 
 
 
278 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  34.21 
 
 
265 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 
246 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.71 
 
 
371 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  36.07 
 
 
363 aa  59.7  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 
277 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  24.71 
 
 
264 aa  59.3  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 
322 aa  59.3  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  26.58 
 
 
236 aa  58.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  25.66 
 
 
292 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  26.46 
 
 
281 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.17 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
262 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  38.32 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  32.11 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 
256 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  31.16 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
348 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  31.16 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3549  HOMODA hydrolase (CmtE)  32.14 
 
 
301 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  40.4 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1775  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.82 
 
 
371 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1748  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.82 
 
 
371 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572248  normal  0.0590997 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 
270 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 
437 aa  56.2  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  31.25 
 
 
265 aa  56.2  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  37.39 
 
 
335 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
316 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 
311 aa  56.2  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
281 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.09 
 
 
370 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  40.59 
 
 
267 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 
301 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  30.77 
 
 
264 aa  55.8  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
303 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
288 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.265351 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
281 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
301 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
504 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  36.36 
 
 
571 aa  55.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
408 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 
353 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>