56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2388 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2388  lipase  100 
 
 
643 aa  1330    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0018  lipase, putative  54.37 
 
 
681 aa  720    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0303  triacylglycerol lipase  43.32 
 
 
645 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0310  triacylglycerol lipase  43.32 
 
 
645 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2297  lipase  39.79 
 
 
688 aa  481  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2751  triacylglycerol lipase  39.76 
 
 
681 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2694  triacylglycerol lipase  39.76 
 
 
681 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2336  lipase, putative  36.73 
 
 
728 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2387  lipase (triacylglycerol lipase)  40.86 
 
 
413 aa  264  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.222994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2624  putative lipase  40.86 
 
 
413 aa  265  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000276049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2432  lipase  40.59 
 
 
400 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0455376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2625  lipase, putative  39.79 
 
 
413 aa  259  8e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0056265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2663  putative lipase  39.79 
 
 
413 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00815188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2527  lipase, putative  39.78 
 
 
413 aa  256  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2353  lipase  40.05 
 
 
413 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2579  putative lipase  39.41 
 
 
413 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2744  putative lipase  38.89 
 
 
413 aa  253  7e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  0.00000452649 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2819  Triacylglycerol lipase  35.79 
 
 
416 aa  209  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  26.53 
 
 
377 aa  61.6  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  28.49 
 
 
561 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  25.14 
 
 
332 aa  53.9  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  28.16 
 
 
332 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  25.58 
 
 
364 aa  50.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  25.58 
 
 
364 aa  50.8  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  24.71 
 
 
364 aa  50.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  24.71 
 
 
341 aa  50.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  24.71 
 
 
360 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  24.71 
 
 
360 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  34.01 
 
 
965 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  34.01 
 
 
965 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
365 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  25.29 
 
 
364 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  25.86 
 
 
364 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  29.22 
 
 
1337 aa  49.7  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  25.86 
 
 
364 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  25.29 
 
 
364 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  29.22 
 
 
1337 aa  49.7  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  25 
 
 
364 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  24.14 
 
 
364 aa  48.1  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  25.29 
 
 
367 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  25.29 
 
 
367 aa  47.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  25.29 
 
 
367 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  25.29 
 
 
367 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  25.29 
 
 
367 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  24.21 
 
 
309 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  25.29 
 
 
367 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  25.29 
 
 
367 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  25.29 
 
 
367 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  25.15 
 
 
309 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  23.69 
 
 
339 aa  45.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  26.15 
 
 
1252 aa  45.4  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  27.48 
 
 
1153 aa  44.3  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  27.48 
 
 
1153 aa  44.3  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0943  adhesion exoprotein  35.58 
 
 
979 aa  44.3  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  29.23 
 
 
308 aa  43.9  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  22.16 
 
 
294 aa  43.9  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>