39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3553 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  100 
 
 		 259 aa  534  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3470  PGAP1 family protein  44.72 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595037  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1654  hypothetical protein  46.74 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  44.34 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  43.75 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  44.17 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  43.7 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1818  hypothetical protein  44.94 
 
 		 262 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3646  hypothetical protein  43.68 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11216  hypothetical protein  40.41 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1474  hypothetical protein  44.58 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1764  hypothetical protein  43.55 
 
 		 284 aa  175  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560768  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2469  hypothetical protein  44.44 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505624  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1301  hypothetical protein  41.36 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130537  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  36.41 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  36 
 
 		 249 aa  115  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  32.54 
 
 		 264 aa  92.4  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  31.13 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0784  PGAP1 family protein  31.73 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  32.84 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  27.49 
 
 		 299 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  29.06 
 
 		 293 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 		 377 aa  48.9  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  25.4 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  29.21 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  29.15 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  29.15 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  25.65 
 
 		 313 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  30.69 
 
 		 298 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  28.99 
 
 		 284 aa  45.4  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3066  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 427 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000595746  normal  0.0576025 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  34.65 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  28.18 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  37.68 
 
 		 309 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 		 365 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33438  predicted protein  41.18 
 
 		 365 aa  42.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.163153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  32 
 
 		 324 aa  42.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 315 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0143781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>