33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2469 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2469  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  503  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505624  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  48.44 
 
 
257 aa  205  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  48.05 
 
 
282 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11216  hypothetical protein  47.06 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1474  hypothetical protein  45.27 
 
 
265 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3470  PGAP1 family protein  47.35 
 
 
264 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595037  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  45.9 
 
 
284 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3646  hypothetical protein  47.68 
 
 
265 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  45.49 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1818  hypothetical protein  46.27 
 
 
262 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100365  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  44.86 
 
 
259 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1654  hypothetical protein  46.12 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1301  hypothetical protein  45.85 
 
 
254 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1764  hypothetical protein  45.34 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560768  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  32.44 
 
 
269 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0784  PGAP1 family protein  37.32 
 
 
269 aa  98.6  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  31.98 
 
 
281 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  33.84 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  31.25 
 
 
264 aa  87.8  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  31.63 
 
 
243 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3674  carboxylesterase  30.51 
 
 
247 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000231487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4922  carboxylesterase  30.51 
 
 
247 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00817956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5233  carboxylesterase  29.66 
 
 
246 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0438362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4957  carboxylesterase  29.91 
 
 
247 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000198319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5215  carboxylesterase  29.91 
 
 
247 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5708  carboxylesterase  29.91 
 
 
247 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00884556  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5244  carboxylesterase  29.91 
 
 
247 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.239449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5279  carboxylesterase  29.91 
 
 
247 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4809  carboxylesterase  29.66 
 
 
247 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4819  carboxylesterase  29.91 
 
 
247 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000134966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5335  carboxylesterase  29.91 
 
 
246 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00681619  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5564  hypothetical protein  36.96 
 
 
296 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3126  carboxylesterase  26.61 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>