22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0954 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0954  esterase/lipase/thioesterase family protein  100 
 
 
218 aa  429  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15641  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.16 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74385 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04171  hypothetical protein  33.5 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0117581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2900  putative lipase  37.32 
 
 
257 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0286742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1214  putative lipase  34.43 
 
 
227 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.132802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2742  hypothetical protein  36.09 
 
 
231 aa  92.8  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.681774  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1213  putative lipase  32.31 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.137275 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43573  predicted protein  35.86 
 
 
317 aa  89  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.021277  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1839  hypothetical protein  36.9 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.028666 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34949  predicted protein  30.84 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1504  hypothetical protein  28.57 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1277  hypothetical protein  26.15 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00102442  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0955  hypothetical protein  28.1 
 
 
251 aa  67  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.486617 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1536  hypothetical protein  25.33 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0780813  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28582  predicted protein  31.25 
 
 
296 aa  63.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.614483  hitchhiker  0.000000143013 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1000  hypothetical protein  26.32 
 
 
239 aa  62  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.621877  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1410  hypothetical protein  25.56 
 
 
234 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414925  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27826  predicted protein  32.5 
 
 
354 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0179342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  26.54 
 
 
294 aa  45.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  36.36 
 
 
293 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  39.29 
 
 
589 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  34.33 
 
 
286 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>