36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1275 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1275  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  100 
 
 
448 aa  905    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.676872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2050  hypothetical protein  50.72 
 
 
436 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171938  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4243  lipase, putative  43.42 
 
 
473 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.48059 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1272  hypothetical protein  40.8 
 
 
450 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0686  twin-arginine translocation pathway signal  28.06 
 
 
475 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0117  twin-arginine translocation pathway signal  27.17 
 
 
457 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0277  hypothetical protein  25.97 
 
 
454 aa  80.9  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  35.51 
 
 
222 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  39.78 
 
 
223 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  30.94 
 
 
222 aa  63.9  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  32.41 
 
 
222 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  32.11 
 
 
217 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  32.65 
 
 
225 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  38.2 
 
 
236 aa  53.1  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5694  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 
285 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  29.25 
 
 
210 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  34.65 
 
 
256 aa  50.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3837  hypothetical protein  28.83 
 
 
455 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
284 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
273 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  23.69 
 
 
313 aa  47.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  31.4 
 
 
298 aa  47.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1839  hypothetical protein  27.47 
 
 
246 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.028666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  28.45 
 
 
278 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
260 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  31.4 
 
 
282 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1296  alpha/beta hydrolase fold protein  31.63 
 
 
292 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0671878  hitchhiker  0.00361499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
270 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 
320 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1214  putative lipase  31.34 
 
 
227 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.132802 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2164  alpha/beta hydrolase  33.98 
 
 
343 aa  44.3  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2409  hydrolase, alpha/beta fold family  33.98 
 
 
343 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  27.35 
 
 
309 aa  43.9  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  29.89 
 
 
294 aa  43.9  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
260 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
268 aa  43.1  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0596048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>