21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2050 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2050  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  875    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1275  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  49.54 
 
 
448 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.676872  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4243  lipase, putative  48.75 
 
 
473 aa  382  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.48059 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1272  hypothetical protein  42.86 
 
 
450 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0117  twin-arginine translocation pathway signal  28.25 
 
 
457 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0686  twin-arginine translocation pathway signal  26.57 
 
 
475 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0277  hypothetical protein  31.25 
 
 
454 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  32.76 
 
 
222 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  25.4 
 
 
217 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  29.41 
 
 
222 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  28.42 
 
 
223 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
320 aa  54.7  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  28.81 
 
 
222 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3837  hypothetical protein  28.7 
 
 
455 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  31.4 
 
 
225 aa  47.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  28.89 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5451  lipase class 2  31 
 
 
338 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 
256 aa  45.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 
280 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  30.83 
 
 
302 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  35.29 
 
 
314 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>